Günther Kaiser, Prof. Dr. Dr. h.c. mult.(*27. Dezember 1928 Walkenried † 3. September 2007 Emmendingen bei Freiburg i.Br.), war ein deutscher Kriminologe und Strafvollzugswissenschafler.
Er war Co-Direktor des Max-Planck-Instituts für ausländisches und internationales Strafrecht in Freiburg, vor allem aber (seit 1970) Gründer und Leiter der kriminologischen Forschungsgruppe dieses Instituts. Zu seinen wichtigsten Veröffentlichungen gehören ein umfangreiches Lehrbuch der Kriminologie (3. Auflage 1996) und ein Lehrbuch zum Strafvollzug (5. Auflage 2002, gemeinsam mit Heinz Schöch). Von 1989 bis 1998 vertrat er die Bundesrepublik Deutschland im Europäischen Ausschuss zur Verhütung von Folter (CPT) und inspizierte in diesem Rahmen zahlreiche Gefängnisse europäischer Staaten.